中國(guó)藥科大學(xué)CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)又又又又又獲國(guó)際金獎(jiǎng)!

中國(guó)藥科大學(xué)
2021-12-14 18:46:36 文/許鵬 圖/洪雅萍
日前,為期8個(gè)月的國(guó)際遺傳工程機(jī)器大賽(international Genetically Engineered Machine Competition, iGEM)2021年賽季正式落下帷幕。新冠疫情為全球帶來(lái)的不確定性,依舊未能阻擋世界各地共計(jì)352支隊(duì)伍在這一合成生物學(xué)領(lǐng)域的最高國(guó)際性學(xué)術(shù)競(jìng)賽中群雄逐鹿。中國(guó)藥科大學(xué)代表隊(duì)CPU_CHINA憑借強(qiáng)大的實(shí)力在大賽上斬獲金獎(jiǎng),為藥大贏得了榮譽(yù),這是所有藥大人的驕傲。
比賽概況
2021年是我校自2017年重返比賽的第五個(gè)年頭,憑借著團(tuán)隊(duì)成員們的熱愛(ài)、努力與堅(jiān)持,CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)再創(chuàng)輝煌,榮獲第五個(gè)iGEM金獎(jiǎng)。此外,CPU_CHINA 2021團(tuán)隊(duì)更上一層樓,于2021賽季斬獲BEST NEW BASIC PART和BEST PART COLLECTION雙單項(xiàng)獎(jiǎng)提名。這不僅代表著我校iGEM賽史結(jié)果的又一個(gè)新的高度,也體現(xiàn)著我校團(tuán)隊(duì)在iGEM競(jìng)賽中日益增長(zhǎng)的知名度和影響力。
團(tuán)隊(duì)成員
本次競(jìng)賽團(tuán)隊(duì)由我校生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院陸美玲副教授及藥學(xué)院陳美容副教授為學(xué)術(shù)指導(dǎo)教師,藥物科學(xué)研究院教師黃惠為領(lǐng)隊(duì),2018級(jí)藥學(xué)(拔尖計(jì)劃)專業(yè)路維軒、2018級(jí)臨床藥學(xué)專業(yè)劉衍鋒為團(tuán)隊(duì)學(xué)生指導(dǎo),2018級(jí)藥學(xué)(拔尖計(jì)劃)鄭林雨、黃子洋為隊(duì)長(zhǎng)。團(tuán)隊(duì)成員為來(lái)自生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院的袁梓涵、劉宮羽、王端端、錢(qián)鴻頡、管健翔,藥學(xué)院的羅鵬、馬如意、陳文韜、沈澤楷、袁瀅,理學(xué)院的張佳,孟目的學(xué)院的王秦月。此外,來(lái)自去年CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)的呂瞳、李笑瑩、劉鑫等同學(xué)構(gòu)成了本屆競(jìng)賽學(xué)生顧問(wèn)團(tuán)體。
接下來(lái),讓我們一起聽(tīng)聽(tīng)隊(duì)員們的參賽感想。
黃子洋 2018級(jí)藥學(xué)(拔尖)專業(yè)
CPU_CHINA Leader
于我而言,參加iGEM是一次對(duì)自己早已習(xí)慣的生活軌跡、方式和節(jié)律的持續(xù)挑戰(zhàn)。長(zhǎng)達(dá)10個(gè)月的鏖戰(zhàn),日復(fù)一日的晝夜顛倒,我比曾經(jīng)任何時(shí)候都更加提心吊膽地審視著自己的一舉一動(dòng),只為哪怕能將隊(duì)伍的進(jìn)展向前再推那么一點(diǎn)。作為一個(gè)缺乏自信的人,任隊(duì)長(zhǎng)的這段時(shí)間,數(shù)不清的挑戰(zhàn)考驗(yàn)著我的身心自洽與自穩(wěn)。所幸,平凡的我遇見(jiàn)了一個(gè)永遠(yuǎn)可以給予信賴的出色團(tuán)隊(duì)?v然風(fēng)暴肆虐,感恩愿作我最堅(jiān)實(shí)后盾的每一位!
鄭林雨 2018級(jí)藥學(xué)(拔尖)專業(yè)
CPU_CHINA Leader
參加iGEM對(duì)我來(lái)說(shuō)是大學(xué)以來(lái)對(duì)自己的一場(chǎng)考驗(yàn),尤其是在2020年我校隊(duì)伍創(chuàng)下我校歷史新高后,作為后輩我們倍感壓力。在漫長(zhǎng)的賽季里,我們不乏爭(zhēng)吵卻也充滿溫情,是大家相互扶持才有最終獲得的成果。
破而后立,iGEM競(jìng)賽是一個(gè)不斷認(rèn)識(shí)自己和突破自我的機(jī)會(huì),希望藥大iGEMer后來(lái)者居上,也祝愿CPU_CHINA越來(lái)越好!
當(dāng)被問(wèn)到獲獎(jiǎng)時(shí)的心情時(shí),鄭林雨說(shuō):“拿金獎(jiǎng)和提名其實(shí)都沒(méi)有特別激動(dòng),更多的是意料之中,覺(jué)得大家這么久以來(lái)的努力都得到回報(bào)和認(rèn)可了,特別欣慰!”鄭林雨認(rèn)為,參加iGEM對(duì)個(gè)人來(lái)說(shuō)是一場(chǎng)考驗(yàn),是對(duì)自身能力的一次鍛煉;對(duì)團(tuán)隊(duì)來(lái)說(shuō),是一次展示水平的機(jī)會(huì)?吹秸麄(gè)團(tuán)隊(duì)一起進(jìn)步,就是參加iGEM的意義。正因所有參賽者的付出,才有了屬于CPU_CHINA今日的榮譽(yù)。
比賽概況
在iGEM 2021賽季中,CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)從CRISPR/dCas9系統(tǒng)和SpyCatcher/SpyTag系統(tǒng)汲取靈感,構(gòu)建了一種可綠色降解聚乙烯塑料的新型蛋白-核酸復(fù)合物。新冠疫情期間,為了減少人員聚集,降低病毒傳播風(fēng)險(xiǎn),人們開(kāi)始更多地使用互聯(lián)網(wǎng)購(gòu)買(mǎi)商品,這使得快遞的收發(fā)量日趨龐大,伴生出大量難以再次回收利用的廢棄聚乙烯塑料,F(xiàn)有的處理方式,焚燒和填埋,處理不當(dāng)時(shí)容易產(chǎn)生有害物質(zhì),占用土地資源與破壞生態(tài)環(huán)境。
CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)的新型蛋白-核酸復(fù)合物,通過(guò)兩種獨(dú)特的連接系統(tǒng),將三種對(duì)聚乙烯降解分別具有貢獻(xiàn)的蛋白質(zhì)連接到了一起:錳過(guò)氧化物酶(MnP)能催化產(chǎn)生高氧化性三價(jià)錳離子,后者在聚乙烯表面引發(fā)自由基氧化反應(yīng),促成碳鏈的斷裂,導(dǎo)致聚乙烯降解;芳基醇氧化酶(AAO)通過(guò)氧化特定的芳香醇為對(duì)應(yīng)的醛類(lèi),為MnP持續(xù)提供必須的底物過(guò)氧化氫,延長(zhǎng)MnP的作用時(shí)間;疏水蛋白1(HFB1)能夠自發(fā)結(jié)合至疏水表面,拉近復(fù)合物與聚乙烯的空間距離,進(jìn)而加速物質(zhì)交換,增強(qiáng)MnP的降解作用。
為了實(shí)現(xiàn)三種功能蛋白的協(xié)同作用,首先通過(guò)SpyCatcher/SpyTag系統(tǒng)將MnP、AAO和HFB1分別與dCas9蛋白相連,形成三種對(duì)應(yīng)的融合蛋白;隨后向每種融合蛋白中分別添加三種不同的單鏈引導(dǎo)RNA(sgRNA),使其各自與dCas9結(jié)合;最后,在sgRNA的引導(dǎo)下,三種融合蛋白得以按照一定的空間順序結(jié)合至經(jīng)過(guò)特殊設(shè)計(jì)的雙鏈DNA(dsDNA),組裝為最終的復(fù)合物。
為了進(jìn)一步提高M(jìn)nP的熱穩(wěn)定性,以增強(qiáng)其聚乙烯降解作用。CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)首次在項(xiàng)目中引入了定向進(jìn)化的策略。通過(guò)分子動(dòng)力學(xué)模擬,突變庫(kù)構(gòu)建、優(yōu)化和篩選,機(jī)器學(xué)習(xí)和主成分分析等干實(shí)驗(yàn)手段,結(jié)合濕實(shí)驗(yàn)的最優(yōu)突變體構(gòu)建,表達(dá),純化與穩(wěn)定性測(cè)試實(shí)驗(yàn),團(tuán)隊(duì)成功獲得了6個(gè)MnP突變體的熱穩(wěn)定性數(shù)據(jù),并從中篩選得到了4個(gè)熱穩(wěn)定性優(yōu)于野生型MnP的突變體。此外,團(tuán)隊(duì)成員針對(duì)功能蛋白MnP和AAO在畢赤酵母中的異源表達(dá)過(guò)程進(jìn)行了數(shù)學(xué)建模,以便對(duì)蛋白表達(dá)量的時(shí)空變化進(jìn)行預(yù)測(cè),優(yōu)化細(xì)胞培養(yǎng)與蛋白獲取的時(shí)間點(diǎn)。
比賽期間,CPU_CHINA團(tuán)隊(duì)與來(lái)自電子科技大學(xué)、同濟(jì)大學(xué)等學(xué)府的參賽隊(duì)伍進(jìn)行了深入與密切的合作,共同促進(jìn)各自項(xiàng)目的前進(jìn);團(tuán)隊(duì)成員針對(duì)廢棄塑料包裝的污染現(xiàn)狀以及塑料降解劑的商業(yè)應(yīng)用進(jìn)行了深入的社會(huì)調(diào)研,獲得了來(lái)自學(xué)術(shù)界與工業(yè)界專家的肯定與支持;同時(shí)舉辦線上藝術(shù)展和校園合成生物學(xué)宣講活動(dòng),展示出我校學(xué)子優(yōu)良的風(fēng)采。一系列工作得到了2021年iGEM評(píng)委的高度評(píng)價(jià)。
經(jīng)驗(yàn)分享
1.團(tuán)隊(duì)管理
要完成一場(chǎng)比賽,一個(gè)項(xiàng)目不是一件容易的事,往往需要一個(gè)團(tuán)隊(duì)通力合作。一個(gè)十多人的團(tuán)隊(duì)運(yùn)行起來(lái),無(wú)論是在工作、實(shí)驗(yàn)還是生活方面或多或少都會(huì)有意見(jiàn)不統(tǒng)一的時(shí)候。尤其是在比賽期間,精神處在高度緊張的情況下,情緒管理就顯得尤為重要。羅鵬說(shuō):“在當(dāng)時(shí)高壓的環(huán)境下,大家的情緒都容易失控,但一想到都是為了團(tuán)隊(duì)和比賽,就能互相包容,繼續(xù)心平氣和的做實(shí)驗(yàn)了”。
在大學(xué)生活中,我們都會(huì)遇到團(tuán)隊(duì)合作,小組討論、課題研討、組隊(duì)比賽等團(tuán)隊(duì)活動(dòng),學(xué)會(huì)傾聽(tīng),互相尊重理解,擁有同理心,是學(xué)會(huì)團(tuán)隊(duì)合作的必修課。
2.協(xié)調(diào)平衡
“魚(yú)和熊掌不能兼得。”有舍才能有得。當(dāng)需要占用假期來(lái)完成實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目時(shí),他們毫無(wú)怨言地選擇在實(shí)驗(yàn)室度過(guò)假期;當(dāng)比賽與學(xué)業(yè)沖突的時(shí)候,他們合理安排時(shí)間,平衡好二者之間的關(guān)系,在不耽誤課業(yè)的同時(shí),完成比賽項(xiàng)目。
大學(xué)生活雖豐富多彩,但如何處理好課內(nèi)外的學(xué)習(xí)與生活一直是大學(xué)生活的難題。這需要我們規(guī)劃好個(gè)人的時(shí)間和精力,做出合理的選擇和安排,在學(xué)有余力的情況下,盡可能地去參加各類(lèi)活動(dòng),充實(shí)自己。馬如意說(shuō):“要做就要投入進(jìn)去做。在對(duì)應(yīng)的時(shí)間,做好該做的事。
他們是新時(shí)代的大學(xué)生
生來(lái)便帶著生機(jī)與力量
加一點(diǎn)志氣,加一點(diǎn)勇氣
再加上無(wú)數(shù)個(gè)奮斗的日夜
換來(lái)那份承載了汗水與努力的金獎(jiǎng)
這是CPU_CHINA的浪漫傳承
這是屬于CPU_CHINA的高光時(shí)刻
愿留少年崢嶸時(shí),
精業(yè)濟(jì)群報(bào)國(guó)家!
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文字|CPU iGEM團(tuán)隊(duì) 黃一婧
圖片|CPU iGEM團(tuán)隊(duì)黃一婧 張銘軒
編輯|牧原
指導(dǎo)|王琳琳